Index: poormanscron.module
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--- poormanscron.module	(revision 90)
+++ poormanscron.module	(working copy)
@@ -87,6 +87,7 @@
         // Truncate the page cache so that cached pages get a new timestamp for
         // the next cron run.
         cache_clear_all('*', 'cache_page', TRUE);
+        unset($_SESSION['messages']);
       }
     }
   }