Here is a list of all file members with links to the files they belong to:

- $ -

• $action : dbsf_daemon.pl
• $cpus : dbsf_daemon.pl
• $db_link : dbsf_daemon.pl
• $dbprefix : dbsf_daemon.pl
• $dir : dbsf_daemon.pl
• $dsn : dbsf_daemon.pl
• $exist_user : dbsf_daemon.pl
• $lock : dbsf_daemon.pl
• $user : dbsf_daemon.pl

- _ -

• __pad0__ : dbsf.info
• __pad1__ : icbasic.info
• _dbsf_generate_options() : dbsf.module

- a -

• allowed : dbsf_daemon.pl

- b -

• blast_head() : dbsf_daemon.pl
• blast_intro() : dbsf_daemon.pl
• blast_title() : dbsf_daemon.pl

- c -

• change_uid() : dbsf_daemon.pl
• check_blast() : dbsf_daemon.pl
• chomp() : dbsf_daemon.pl
• connecttodb() : dbsf_daemon.pl
• Conservation : dbsf_daemon.pl

- d -

• daemonize() : dbsf_daemon.pl
• DBI : dbsf_daemon.pl
• dbsf_add_software_blast() : dbsf.install
• dbsf_add_software_option() : dbsf.install
• dbsf_add_software_ssaha2() : dbsf_ssaha2.inc
• dbsf_admin_blast_page() : dbsf.module
• dbsf_admin_database_files_table() : dbsf.module
• dbsf_admin_database_table() : dbsf.module
• dbsf_admin_dataset_page() : dbsf.module
• dbsf_admin_dataset_perms_form() : dbsf.module
• dbsf_admin_dataset_perms_form_submit() : dbsf.module
• dbsf_admin_dataset_variables_form() : dbsf.module
• dbsf_admin_dataset_variables_form_submit() : dbsf.module
• dbsf_admin_dataset_variables_form_validate() : dbsf.module
• dbsf_admin_link_dataset_software_form() : dbsf.module
• dbsf_admin_link_dataset_software_form_submit() : dbsf.module
• dbsf_admin_link_dataset_software_form_validate() : dbsf.module
• dbsf_admin_newdataset_form() : dbsf.module
• dbsf_admin_newdataset_form_submit() : dbsf.module
• dbsf_admin_newdataset_form_validate() : dbsf.module
• dbsf_admin_page() : dbsf.module
• dbsf_admin_software_page() : dbsf.module
• dbsf_admin_ssaha2_page() : dbsf_ssaha2.inc
• dbsf_batch_save_data() : dbsf.module
• dbsf_batch_upload_fasta() : dbsf.module
• dbsf_blast_batch_finished() : dbsf.module
• dbsf_blast_form() : dbsf.module
• dbsf_blast_form_submit() : dbsf.module
• dbsf_blast_form_validate() : dbsf.module
• dbsf_blast_page() : dbsf.module
• dbsf_blast_result_form() : dbsf.module
• dbsf_blast_result_page() : dbsf.module
• dbsf_blast_result_xml() : dbsf.module
• dbsf_blastall_software_pars() : dbsf.module
• dbsf_check_blast() : dbsf.module
• dbsf_check_software_active() : dbsf.module
• dbsf_check_ssaha2() : dbsf_ssaha2.inc
• dbsf_cron() : dbsf.module
• dbsf_delete_temp() : dbsf.module
• dbsf_form_clear() : dbsf.module
• dbsf_formatdb_fastafile() : dbsf.module
• dbsf_get_dataset_path() : dbsf.module
• dbsf_get_resource_roles() : dbsf.module
• dbsf_get_role() : dbsf.module
• dbsf_get_sequence() : dbsf.module
• dbsf_get_software() : dbsf.module
• dbsf_get_software_resources() : dbsf.module
• dbsf_get_softwareprop() : dbsf.module
• dbsf_get_user_datasets() : dbsf.module
• dbsf_init() : dbsf.module
• dbsf_install() : dbsf.install
• dbsf_link_unlink_resource_role() : dbsf.module
• dbsf_link_unlink_software_resource() : dbsf.module
• dbsf_menu() : dbsf.module
• dbsf_parameter_daemon() : dbsf.module
• dbsf_perm() : dbsf.module
• dbsf_schema() : dbsf.install
• dbsf_software_blast_core_settings_form() : dbsf.module
• dbsf_software_blast_core_settings_form_submit() : dbsf.module
• dbsf_software_blast_core_settings_form_validate() : dbsf.module
• dbsf_software_form() : dbsf.module
• dbsf_software_form_submit() : dbsf.module
• dbsf_software_select_page() : dbsf.module
• dbsf_software_ssaha2_core_settings_form() : dbsf_ssaha2.inc
• dbsf_software_ssaha2_core_settings_form_submit() : dbsf_ssaha2.inc
• dbsf_software_ssaha2_core_settings_form_validate() : dbsf_ssaha2.inc
• dbsf_ssaha2_form() : dbsf_ssaha2.inc
• dbsf_ssaha2_form_submit() : dbsf_ssaha2.inc
• dbsf_ssaha2_form_validate() : dbsf_ssaha2.inc
• dbsf_ssaha2_menu() : dbsf_ssaha2.inc
• dbsf_ssaha2_page() : dbsf_ssaha2.inc
• dbsf_ssaha2_result_page() : dbsf_ssaha2.inc
• dbsf_theme() : dbsf.module
• dbsf_theme_blast_result_form() : dbsf.module
• dbsf_uninstall() : dbsf.install
• disconnectdb() : dbsf_daemon.pl

- e -

• Exeter : dbsf_daemon.pl

- f -

• Fcntl : dbsf_daemon.pl

- g -

• get_pars() : dbsf_daemon.pl
• get_uid() : dbsf_daemon.pl
• GetOptions() : dbsf_daemon.pl

- h -

• handler : dbsf_daemon.pl
• host : dbsf_daemon.pl

- i -

• icbasic_add_cv() : icbasic.module
• icbasic_array2csv() : icbasic.module
• icbasic_chadoapi_get_single_table() : icbasic.module
• icbasic_checkboxes_results2array() : icbasic.module
• icbasic_clear_session() : icbasic.module
• icbasic_create_uid() : icbasic.module
• icbasic_db_execute() : icbasic.module
• icbasic_decode() : icbasic.module
• icbasic_disable() : icbasic.install
• icbasic_enable() : icbasic.install
• icbasic_encode() : icbasic.module
• icbasic_get_add_cv_withnames() : icbasic.module
• icbasic_get_add_dbxref_withnames() : icbasic.module
• icbasic_get_add_resource() : icbasic.module
• icbasic_get_linked_resources() : icbasic.module
• icbasic_get_resource_cvterm_and_prop() : icbasic.module
• icbasic_get_resource_name_id() : icbasic.module
• icbasic_init() : icbasic.module
• icbasic_install() : icbasic.install
• icbasic_link_unlink_resources() : icbasic.module
• icbasic_populate_cvterms() : icbasic.module
• icbasic_populate_prop() : icbasic.module
• icbasic_schema() : icbasic.install
• icbasic_uninstall() : icbasic.install
• icbasic_validate_ic_id() : icbasic.module
• icbasic_validate_seq_dna() : icbasic.module
• icbasic_validate_seq_protein() : icbasic.module
• icbasic_write_fastafile() : icbasic.module
• if() : dbsf_daemon.pl

- k -

• killme() : dbsf_daemon.pl

- m -

• my() : dbsf_daemon.pl

- n -

• n : dbsf_daemon.pl

- o -

• org : dbsf_daemon.pl

- p -

• password : dbsf_daemon.pl
• port : dbsf_daemon.pl
• process_blast() : dbsf_daemon.pl

- q -

• qw() : dbsf_daemon.pl

- r -

• readlock() : dbsf_daemon.pl

- s -

• signals : dbsf_daemon.pl
• statusme() : dbsf_daemon.pl

- u -

• umask : dbsf_daemon.pl
• unlock : dbsf_daemon.pl
• user : dbsf_daemon.pl

- v -

• v : dbsf.info

- w -

• while() : dbsf_daemon.pl